Photo-cross-linkable artificial nucleic acid: Synthesis and properties of 3-cyanovinylcarbazole-modified nucleic acids and its photo-induced gene-silencing activity in cells

Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto （Part： Lead author )

Synthesis of Therapeutic Oligonucleotides     171 - 186   2018.12  [Refereed]

DOI

Disassembly-driven signal turn-on probes for bimodal detection of DNA with 19F NMR and fluorescence

Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto （Part： Lead author,　Corresponding author )

Organic & Biomolecular Chemistry ( Royal Society of Chemistry ({RSC}) )    2018  [Refereed]

DOI

Effect of nucleobase change on cytosine deamination through DNA photo-cross-linking reaction via 3-cyanovinylcarbazole nucleoside.

Sethi S, Ooe M, Sakamoto T, Fujimoto K

    2017.04  [Refereed]

DOI

Characterization of human telomere RNA G-quadruplex structures in vitro and in living cells using 19F NMR spectroscopy.

Bao HL, Ishizuka T, Sakamoto T, Fujimoto K, Uechi T, Kenmochi N, Xu Y

    2017.02  [Refereed]

DOI

UVA-responsive Anticancer Prodrugs Based on Photoinduced Electron Injection into Oligonucleotide Having 5-Halouracils

Fujimoto, Kenzo, Furusawa, Mirei, Nakamura, Shigetaka, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

Chemistry Letters ( The Chemical Society of Japan )  45 ( 9 ) 1078 - 1080   2016.06  [Refereed]

DOI

Simultaneous detection of single-nucleotide polymorphisms in a DNA bulge structure using a fluorine-modified bisbenzimide derivative

Sakamoto, Takashi, Hasegawa, Daisaku, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author,　Corresponding author )

Analyst ( Royal Society of Chemistry )  141 ( 4 ) 1214 - 1217   2016.02  [Refereed]

DOI

Photo-Cross-Linking Reaction in Nucleic Acids: Chemistry and Applications

Sakamoto, Takashi, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author )

Modified Nucleic Acids ( Springer )    145 - 157   2016  [Refereed]

RNA fluorescence in situ hybridization using 3-cyanovinylcarbazole modified oligodeoxyribonucleotides as photo-cross-linkable probes

Fujimoto, Kenzo, Toyosato, Kei, Nakamura, Shigetaka, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters ( Pergamon )  26 ( 21 ) 5312 - 5314   2016  [Refereed]

DOI

Critical effect of base pairing of target pyrimidine on the interstrand photo-cross-linking of DNA via 3-cyanovinylcarbazole nucleoside

Sakamoto, Takashi, Ooe, Minako, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author )

Bioconjugate chemistry ( ACS Publications )  26 ( 8 ) 1475 - 1478   2015  [Refereed]

DOI

DNA photo-cross-linking using 3-cyanovinylcarbazole modified oligonucleotide with threoninol linker

Sakamoto, Takashi, Tanaka, Yuya, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author )

Organic letters ( ACS Publications )  17 ( 4 ) 936 - 939   2015  [Refereed]

DOI

Changing blue fluorescent protein to green fluorescent protein using chemical RNA editing as a novel strategy in genetic restoration

Vu, Luyen T, Nguyen, Thanh TK, Alam, Shafiul, Sakamoto, Takashi, Fujimoto, Kenzo, Suzuki, Hitoshi, Tsukahara, Toshifumi

Chemical biology & drug design ( Wiley Online Library )  86 ( 5 ) 1242 - 1252   2015  [Refereed]

DOI

Fluorine-modified bisbenzimide derivative as a molecular probe for bimodal and simultaneous detection of DNAs by 19 F NMR and fluorescence

Sakamoto, Takashi, Hasegawa, Daisaku, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author,　Corresponding author )

Chemical Communications ( Royal Society of Chemistry )  51 ( 42 ) 8749 - 8752   2015  [Refereed]

DOI

Short oligonucleotide prodrug having 5-fluoro and 5-iodouracil inhibits the proliferation of cancer cells in a photo-responsive manner

Fujimoto, Kenzo, Takematsu, Yu-ki, Shigeno, Atsuo, Furusawa, Mirei, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

Bioorganic & medicinal chemistry letters ( Elsevier )  24 ( 16 ) 3736 - 3738   2014  [Refereed]

DOI

Photo-regulation of constitutive gene expression in living cells by using ultrafast photo-cross-linking oligonucleotides

Sakamoto, Takashi, Shigeno, Atsuo, Ohtaki, Yuichi, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author )

Biomaterials Science ( Royal Society of Chemistry )  2 ( 9 ) 1154 - 1157   2014  [Refereed]

DOI

Diamine Derivatives Accelerate Photochemical C→ U Transition in DNA Double Strand

Fujimoto, Kenzo, Futamura, Daiki, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

Chemistry Letters ( The Chemical Society of Japan )  42 ( 3 ) 289 - 291   2013  [Refereed]

DOI

Quick and reversible photocrosslinking reaction of 3-cyanovinylcarbazole nucleoside in a DNA triplex

Fujimoto, Kenzo, Yoshinaga, Hiroki, Yoshio, Yasumasa, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

Organic & biomolecular chemistry ( Royal Society of Chemistry )  11 ( 31 ) 5065 - 5068   2013  [Refereed]

DOI

Quick, selective and reversible photocrosslinking reaction between 5-methylcytosine and 3-cyanovinylcarbazole in DNA double strand

Fujimo, Kenzo, Konishi-Hiratsuka, Kaoru, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

International journal of molecular sciences ( Multidisciplinary Digital Publishing Institute )  14 ( 3 ) 5765 - 5774   2013  [Refereed]

DOI

Geometric Effect on the Photocrosslinking Reaction between 3-Cyanovinylcarbazole Nucleoside and Pyrimidine Base in DNA/RNA Heteroduplex

Fujimoto, Kenzo, Kishi, Satomi, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

Photochemistry and photobiology ( Wiley Online Library )  89 ( 5 ) 1095 - 1099   2013  [Refereed]

DOI

Details of the ultrafast DNA photo-cross-linking reaction of 3-cyanovinylcarbazole nucleoside: cis--trans isomeric effect and the application for SNP-based genotyping

Fujimoto, Kenzo, Yamada, Asuka, Yoshimura, Yoshinaga, Tsukaguchi, Tadashi, Sakamoto, Takashi （Part： Last author )

Journal of the American Chemical Society ( ACS Publications )  135 ( 43 ) 16161 - 16167   2013  [Refereed]

DOI

Development about photochemical DNA and RNA crosslinking via 3-cyanovinylcarbazole

Satomi Kishi, Daiki Futamura, Kaoru Hiratsuka, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY ( AMER CHEMICAL SOC )  243   2012.03  [Refereed]

Regulation of gene expression by photocrosslinking oligonucleotide containing of carbazole

Atsuo Shigeno, Sakamoto Takashi, Kenzo Fujimoto

ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY ( AMER CHEMICAL SOC )  243   2012.03  [Refereed]

Quick regulation of mRNA functions by a few seconds of photoirradiation

Shigeno, Atsuo, Sakamoto, Takashi, Yoshimura, Yoshinaga, Fujimoto, Kenzo

Organic & biomolecular chemistry ( Royal Society of Chemistry )  10 ( 38 ) 7820 - 7825   2012  [Refereed]

DOI

Specific and reversible photochemical labeling of plasmid DNA using photoresponsive oligonucleotides containing 3-cyanovinylcarbazole

Fujimoto, Kenzo, Hiratsuka-Konishi, Kaoru, Sakamoto, Takashi, Ohtake, Tomoko, Shinohara, Ken-ichi, Yoshimura, Yoshinaga

Molecular BioSystems ( Royal Society of Chemistry )  8 ( 2 ) 491 - 494   2012  [Refereed]

DOI

Signal turn-on probe for nucleic acid detection based on 19 F nuclear magnetic resonance

Sakamoto, Takashi, Shimizu, Yu-ki, Sasaki, Jun, Hayakawa, Hikaru, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author )

Bioorganic & medicinal chemistry letters ( Elsevier )  21 ( 1 ) 303 - 306   2011  [Refereed]

DOI

5-Methylcytosine selective photoligation using photoresponsive oligonucleotides containing various 5-vinyl-2′-deoxyuridines having an aromatic group

Sakamoto, Takashi, Ami, Takehiro, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author )

Chemistry Letters ( The Chemical Society of Japan )  41 ( 1 ) 47 - 49   2011  [Refereed]

DOI

Development of a Potassium Ion Sensor for 19F Magnetic Resonance Chemical Shift Imaging Based on Fluorine-labeled Thrombin Aptamer

Sakamoto, Takashi, Hayakawa, Hikaru, Fujimoto, Kenzo （Part： Lead author )

Chemistry Letters ( The Chemical Society of Japan )  40 ( 7 ) 720 - 721   2011  [Refereed]

DOI

1P346 DNA computing based on photochemical DNA manipulation(Miscellaneous topics,The 48th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan)

Ogasawara Shinji, Sakamoto Takashi, Nakamura Shigetaka, Fujimoto Kenzo

Seibutsu Butsuri ( The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association )  50 ( 2 ) S81   2010

DOI

Site-specific photochemical RNA editing

Fujimoto, Kenzo, Konishi-Hiratsuka, Kaoru, Sakamoto, Takashi, Yoshimura, Yoshinaga

Chemical Communications ( Royal Society of Chemistry )  46 ( 40 ) 7545 - 7547   2010  [Refereed]

DOI

Site-Specific Cytosine to Uracil Transition by Using Reversible DNA Photo-crosslinking

Fujimoto, Kenzo, Konishi-Hiratsuka, Kaoru, Sakamoto, Takashi, Yoshimura, Yoshinaga

ChemBioChem ( Wiley Online Library )  11 ( 12 ) 1661 - 1664   2010  [Refereed]

DOI

Molecular recognition, fluorescence sensing, and biological assay of phosphate anion derivatives using artificial Zn (II)--Dpa complexes

Sakamoto, Takashi, Ojida, Akio, Hamachi, Itaru （Part： Lead author )

Chemical Communications ( Royal Society of Chemistry )  ( 2 ) 141 - 152   2009  [Refereed]

DOI

Self-assembling nanoprobes that display off/on 19F nuclear magnetic resonance signals for protein detection and imaging

Takaoka, Yousuke, Sakamoto, Takashi, Tsukiji, Shinya, Narazaki, Michiko, Matsuda, Tetsuya, Tochio, Hidehito, Shirakawa, Masahiro, Hamachi, Itaru

Nature chemistry ( Nature Publishing Group )  1 ( 7 ) 557 - 561   2009  [Refereed]

DOI

Fluorescent BODIPY-based Zn (II) complex as a molecular probe for selective detection of neurofibrillary tangles in the brains of Alzheimer’s disease patients

Ojida, Akio, Sakamoto, Takashi, Inoue, Masa-aki, Fujishima, Sho-hei, Lippens, Guy, Hamachi, Itaru

Journal of the American Chemical Society ( ACS Publications )  131 ( 18 ) 6543 - 6548   2009  [Refereed]

DOI

Real-time fluorescence monitoring of GSK3$β$-catalyzed phosphoryation by use of a BODIPY-based Zn (II)--Dpa chemosensor

Sakamoto, Takashi, Inoue, Masa-aki, Ojida, Akio, Hamachi, Itaru （Part： Lead author )

Bioorganic & medicinal chemistry letters ( Elsevier )  19 ( 15 ) 4175 - 4177   2009  [Refereed]

DOI

Microarray-based label-free detection of RNA using bispyrene-modified 2′-O-methyl oligoribonucleotide as capture and detection probe

Sakamoto, Takashi, Kobori, Akio, Murakami, Akira （Part： Lead author )

Bioorganic & medicinal chemistry letters ( Elsevier )  18 ( 8 ) 2590 - 2593   2008  [Refereed]

DOI

Transcriptome analysis device based on liquid phase detection by fluorescently labeled nucleic acid probes

Yokokawa, Ryuji, Tamaoki, Soichiro, Sakamoto, Takashi, Murakami, Akira, Sugiyama, Susumu

Biomedical microdevices ( Springer )  9 ( 6 ) 869 - 875   2007  [Refereed]

DOI

Real-time monitoring of antibody secretion from B-cells on a microchip stimulated with a minute amount of mitogen

Munaka, Tatsuya, Abe, Hirohisa, Kanai, Masaki, Sakamoto, Takashi, Nakanishi, Hiroaki, Shoji, Shuichi, Kimura, Shinya, Maekawa, Taira, Murakami, Akira

Analyst ( Royal Society of Chemistry )  132 ( 6 ) 512 - 514   2007  [Refereed]

DOI

Homogeneous Fluorescence Assays for RNA Diagnosis by Pyrene-Conjugated 2′-O-Methyloligoribonucleotides

Sakamoto, Takashi, Kobori, Akio, Shigezawa, Masako, Amitani, Yasutaka, Higuchi, Maiko, Murakami, Akira （Part： Lead author )

Nucleosides, Nucleotides, and Nucleic Acids ( Taylor \& Francis )  26 ( 10-12 ) 1659 - 1664   2007  [Refereed]

DOI

Properties of novel antisense oligonucleotides containing 2′-O-modified adenosine with a photo-reactive group

Higuchi Maiko, Sakamoto Takashi, Kobori Akio, Murakami Akira

Nucleic Acids Symposium Series   50 ( 1 ) 301 - 2   2006  [Refereed]

Solid-phase detection of RNA using bispyrene-modified RNA probe

Sakamoto Takashi, Kobori Akio, Murakami Akira （Part： Lead author )

Nucleic Acids Symposium Series   50 ( 1 ) 215 - 6   2006  [Refereed]

Monitoring cellular events in living mast cells stimulated with an extremely small amount of fluid on a microchip

Munaka, Tatsuya, Abe, Hirohisa, Kanai, Masaki, Sakamoto, Takashi, Nakanishi, Hiroaki, Yamaoka, Tetsuji, Shoji, Shuichi, Murakami, Akira

Japanese journal of applied physics ( IOP Publishing )  45 ( 7L ) L634   2006  [Refereed]

DOI

Real-time monitoring of antibody secretion from hybridomas on a microchip by time-resolved luminescence anisotropy analysis

Munaka, Tatsuya, Abe, Hirohisa, Kanai, Masaki, Sakamoto, Takashi, Nakanishi, Hiroaki, Yamaoka, Tetsuji, Shoji, Shuichi, Murakami, Akira

Analytical biochemistry ( Elsevier )  353 ( 1 ) 1 - 6   2006  [Refereed]

DOI

Development of the cell analysis chip (II)

Tatsuya Munaka, Masaki Kanai, Hirohisa Abe, Hiroaki Nakanishi, Takashi Sakamoto, Akio Kobori, Tetsuji Yamaoka, Shuichi Shoji, Akira Murakami

Polymer Preprints, Japan   54 ( 1 ) 2329   2005  [Refereed]

Transcriptome Analyzing Chip Based on Liquid-phase Detection Using Fluorescence Labeled Nucleic Acid Probe

Tamaoki S, Sugiyama S, Sakamoto T, Murakami A

PROCEEDINGS OF THE SENSOR SYMPOSIUM ON SENSORS MICROMACHINES AND APPLIED SYSTEMS   22   270   2005  [Refereed]

Evaluation of dynamic features of Escherichia coli 16S ribosomal RNA in homogeneous physiological solution

Sakamoto, Takashi, Mahara, Atsushi, Yamagata, Koichi, Iwase, Reiko, Yamaoka, Tetsuji, Murakami, Akira （Part： Lead author )

Biophysical journal ( Elsevier )  89 ( 6 ) 4122 - 4128   2005  [Refereed]

DOI

Luminescence anisotropy-based detection of nucleic acids and proteins using long-lifetime Ru(II) complex as a luminescent label.

Takashi Sakamoto, Atsushi Mahara, Kobori Akio, Tetsuji Yamaoka, Akira Murakami （Part： Lead author )

Nucleic acids symposium series (2004)   49 ( 49 ) 203 - 204   2005  [Refereed]

Analytical method for estimation of kinetics of oligonucleotide/RNA hybridization using fluorescence depolarization spectroscopy

Sakamoto, Takashi, Mahara, Atsushi, Iwase, Reiko, Yamaoka, Tetsuji, Murakami, Akira （Part： Lead author )

Analytical biochemistry ( Academic Press )  340 ( 2 ) 369 - 372   2005  [Refereed]

DOI

Time-resolved luminescence anisotropy-based detection of immunoglobulin G using long-lifetime Ru (II) complex-labeled protein A

Sakamoto, Takashi, Mahara, Atsushi, Munaka, Tatsuya, Yamagata, Koich, Iwase, Reiko, Yamaoka, Tetsuji, Murakami, Akira （Part： Lead author )

Analytical biochemistry ( Academic Press )  329 ( 1 ) 142 - 144   2004  [Refereed]

DOI

Transcriptome analysis using fluorescence-labeled oligonucleotide.

Naohiko Shimada, Atsushi Mahara, Takashi Sakamoto, Tetsuji Yamaoka, Akira Murakami

Nucleic acids symposium series (2004)   48 ( 48 ) 301 - 302   2004  [Refereed]

In situ Cell Monitoring on a Microchip using Time-Resolved Fluorescence Anisotropy Analysis

Sakamoto Takashi, Mahara Atsushi, Yamayoshi Asako

Seibutsu Butsuri ( The Biophysical Society of Japan General Incorporated Association )  43   S222   2003.10  [Refereed]

DOI

RNAの機能・構造解析に用いる螢光RNAプローブの開発

村上 章, 坂本 隆, 馬原 淳

化学と生物 ( Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry )  41 ( 8 ) 549 - 556   2003.08

DOI

Detection of acceptor sites for antisense oligonucleotides on native folded RNA by fluorescence-labeled oligonucleotide.

Atsushi Mahara, Takashi Sakamoto, Tatsuya Munaka, Reiko Iwase, Tetsuji Yamaoka, Akira Murakami

Nucleic acids research. Supplement (2001)   3 ( 3 ) 73 - 74   2003  [Refereed]

Detection of acceptor sites for antisense oligonucleotides on native folded RNA by fluorescence spectroscopy

Mahara, Atsushi, Iwase, Reiko, Sakamoto, Takashi, Yamaoka, Tetsuji, Yamana, Kazushige, Murakami, Akira

Bioorganic & medicinal chemistry ( Elsevier )  11 ( 13 ) 2783 - 2790   2003  [Refereed]

DOI

Bispyrene-conjugated 2'-O-methyloligonucleotide as a highly specific RNA-recognition probe.

Atsushi Mahara, Reiko Iwase, Takashi Sakamoto, Kazushige Yamana, Tetsuji Yamaoka, Akira Murakami

Angewandte Chemie (International ed. in English)   41 ( 19 ) 3648 - 50   2002.10

Bispyrene-Conjugated 2′-O-Methyloligonucleotide as a Highly Specific RNA-Recognition Probe

Mahara, Atsushi, Iwase, Reiko, Sakamoto, Takashi, Yamana, Kazushige, Yamaoka, Tetsuji, Murakami, Akira

Angewandte Chemie ( WILEY-VCH Verlag )  114 ( 19 ) 3800 - 3802   2002  [Refereed]

DOI

Study on structure of ribosomal RNA by time-resolved luminescence anisotropy analysis.

T. Sakamoto, A. Mahara, R. Iwase, T. Yamaoka, A. Murakami （Part： Lead author )

Nucleic acids research. Supplement (2001)   1 ( 1 ) 143 - 144   2001  [Refereed]

DOI

ヘキスト系色素の非標準構造DNAに対する光反応の検討

三輪好輝, 瀬戸上慧, 坂本隆

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   99th   2019

DNAマイナーグルーブ結合型蛍光色素を用いたハイブリダイゼーション連鎖反応のラベルフリー検出

山田陸斗, 坂本隆, 坂本隆

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   99th   2019

¹⁹F NMRを用いた核酸等生体分子の同時一斉計測技術の開発

坂本隆, 長谷川大策, QIU Zhiyong, 藤本健造

バイオ・高分子シンポジウム講演要旨集   27th   2017

フッ素標識ヘキストプローブを用いた¹⁹F NMRによるDNA検出

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

バイオ・高分子シンポジウム講演要旨集   26th   2016

¹⁹F NMRを用いたDNA1塩基多型の同時一斉解析

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   96th   2016

光か学的なRNA架橋反応を用いた新規FISH法の開発

中村重孝, 豊里慧, 狩野千波, 坂本隆, 藤本健造

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   39th   2016

フッ素修飾ビスベンズイミド誘導体を用いた¹⁹F NMRによるDNAのOFF/ON検出

長谷川大策, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   96th   2016

グリシドール骨格を有するDNA光架橋素子の合成とその機能評価

望月卓海, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   96th   2016

3-シアノビニルカルバゾールを含む光応答性オリゴDNAプローブを用いた新規FISH法の開発

豊里慧, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   96th   2016

Hoechst33258骨格を有するDNA検出¹⁹F核磁気共鳴プローブの開発

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   95th ( 3 )   2015

可逆的光架橋反応を用いたシトシンの脱アミノ化反応における相補塩基の効果

大江美成子, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   95th ( 3 )   2015

¹⁹F核磁気共鳴による核酸検出を可能とする新規分子プローブの開発

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

バイオ・高分子シンポジウム講演要旨集   25th   2015

マルチモードイメージングを目指した新規核酸イメージングプローブの開発

脇田和明, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   94th ( 3 )   2014

高速光架橋性アンチセンス核酸による定常発現遺伝子の細胞内制御

坂本隆, 滋野敦夫, 大滝優一, 藤本健造, 藤本健造

アンチセンスシンポジウム講演要旨集   24th   2014

3-シアノビニルカルバゾールヌクレオシドによるDNA光クロスリンク反応におけるピリミジン5位の置換基効果

村松穂高, 中村重孝, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   94th ( 3 )   2014

3-シアノビニルカルバゾールとトレオニノール骨格を有する新規DNA・RNA光クロスリンカーの開発

田中佑弥, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   94th ( 3 )   2014

光架橋性オリゴヌクレオチドによる細胞内遺伝子発現制御法の開発

坂本隆, 滋野敦夫, 大滝優一, 藤本健造, 藤本健造

日本光医学・光生物学会   36th   2014

カルバゾール誘導体を含む光応答性アンチセンス核酸を用いた遺伝子発現制御

滋野敦夫, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   93rd ( 3 )   2013

シュードウリジンに対する可逆的光架橋反応の開発

岸里美, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   93rd ( 3 )   2013

三重鎖DNA中における高速光架橋反応開発

吉永広樹, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   93rd ( 3 )   2013

2重鎖DNA光クロスリンク反応に関する反応解析

山田明日香, 坂本隆, 吉村嘉永, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   93rd ( 3 )   2013

カルバゾール誘導体を用いたDNA光架橋反応機構解析

山田明日香, 坂本隆, 吉村嘉永, 池田真由美, 藤本健造, 藤本健造

高分子学会北陸支部研究発表講演会講演要旨集   61st   2012

ビニルカルバゾール含有光応答性人工核酸を用いた光化学的遺伝子発現制御

滋野敦夫, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

アンチセンスシンポジウム講演要旨集   22nd   2012

カルバゾール誘導体によるRNAへの光架橋反応を用いた光化学的な遺伝子発現制御

大滝優一, 滋野敦夫, 坂本隆, 藤本健造

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   35th   2012

三重鎖DNA中における高速光架橋反応開発

吉永広樹, 吉尾泰政, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

高分子学会北陸支部研究発表講演会講演要旨集   61st   2012

高速光架橋能をもつアンチセンス核酸による遺伝子発現制御

大滝優一, 滋野敦夫, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

高分子学会北陸支部研究発表講演会講演要旨集   61st   2012

Pseudouridineに対する可逆的光架橋反応の開発

岸里美, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

高分子学会北陸支部研究発表講演会講演要旨集   61st   2012

高速光架橋能をもつアンチセンス核酸による細胞内遺伝子発現制御

坂本隆, 滋野敦夫, 大滝優一, 藤本健造, 藤本健造

アンチセンスシンポジウム講演要旨集   22nd   2012

光クロスリンクを用いた選択的核酸増幅法の開発

渡邊誉, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   91st ( 3 )   2011

フッ素化合物修飾オリゴDNAを用いた¹⁹FNMRによる核酸の検出

坂本隆, 清水勇喜, 佐々木淳, 早川輝, 藤本健造, 藤本健造

日本化学会バイオテクノロジー部会シンポジウム講演要旨集   14th   2011

カルバゾール誘導体を含む光架橋性アンチセンス核酸による遺伝子発現制御

滋野敦夫, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

日本化学会バイオテクノロジー部会シンポジウム講演要旨集   14th   2011

カリウムイオンをセンシングする19F MRI用造影プローブの開発

早川輝, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   91st ( 3 )   2011

核酸のIn vivoイメージングを目指したフッ素核磁気共鳴OFF/ONプローブの開発:マルチフッ素ラベリングによる検出感度改善

坂本隆, 清水勇喜, 佐々木淳, 早川輝, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   91st ( 3 )   2011

光化学的なDNA及びRNAピンポイント編集

二村大樹, 平塚薫, 吉村嘉永, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   91st ( 3 )   2011

¹⁹F核磁気共鳴による生体分子イメージングを指向したフッ素修飾核酸プローブの合成

坂本隆, 早川輝, 清水勇喜, 佐々木淳, 藤本健造, 藤本健造

有機合成化学セミナー講演予稿集   28th   2011

可逆的DNA光クロスリンクオリゴによるDNAナノ構造の安定制御

中村重孝, 坂本隆, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   91st ( 3 )   2011

カリウムイオンをセンシングする¹⁹F MRI用造影プローブの開発

早川輝, 佐々木淳, 坂本隆, 藤本健造, 藤本健造

日本化学会バイオテクノロジー部会シンポジウム講演要旨集   14th   2011

核酸のin vivo検出・イメージングのための¹⁹F核磁気共鳴シグナルOff/Onプローブ

坂本隆, 清水勇喜, 佐々木淳, 藤本健造

日本化学会講演予稿集   90th ( 3 )   2010

遺伝子発現のin vivoイメージングを目指したフッ素核磁気共鳴プローブの開発

坂本隆, 清水勇希, 佐々木淳, 早川輝, 藤本健造

日本化学会バイオテクノロジー部会シンポジウム講演要旨集   13th   2010

シアノビニルカルバゾール修飾オリゴDNAを用いた光化学的DNA編集

坂本隆, 池田真由美, 二村大樹, 吉村嘉永, 平塚薫, 藤本健造

日本化学会バイオテクノロジー部会シンポジウム講演要旨集   13th   2010

Fluorescence anisotropy-based detection of immunoglobulin G using a long-lifetime fluorophore

坂本隆, 務中達也, 馬原淳, 山形浩一, 山岡哲二, 村上章

日本化学会講演予稿集   84th ( 2 )   2004

マイクロチップを用いた蛍光時間分解偏光解消法による細胞機能の経時的解析

務中達也, 叶井正樹, 藤山陽一, 阿部浩久, 中西博昭, 坂本隆, 馬原淳, 山岡哲二, 村上章

バイオ・高分子シンポジウム講演要旨集   14th   2004

Development of long-lifetime Ru(II) complex labeled oligonucleotide for analysis of RNA structure.

坂本隆, 馬原淳, 岩瀬礼子, 山岡哲二, 村上章

日本化学会講演予稿集   79th ( 2 )   2001

長寿命発光能を有するRu(II)錯体を用いたRNA高次構造解析

坂本隆, 馬原淳, 岩瀬礼子, 山岡哲二, 村上章

高分子学会予稿集   50 ( 5 )   2001

DNA２重鎖・４重鎖二色蛍光スイッチオンプローブの結合選択性の制御

村岡 優香, 安原 優, 岩井 まり奈, 坂本 隆

日本化学会第103春季年会  2023.03.22  

がんの光線力学療法を志向した三脚型キノン−シアニン色素の活性酸素生成能の評価

村元順哉, 安原優, 坂本隆

日本化学会第103春季年会  2023.03.22  

Controlling the fluorescence response of tripodal quinone-cyanine dyes upon nucleic acid binding

Takashi Sakamoto, Yuka Muraoka, Yu Yasuhara, Marina Iwai

The 49th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2022)  2022.11.03  

がんの光線力学療法を指向した３脚型キノンーシアニン色素の光増感活性の評価

村元順哉, 安原優, 坂本隆

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022.09.10  

３脚型キノン-シアニン蛍光色素の核酸構造認識を制御するための化学修飾

村岡優香, 安原優, 岩井まり奈, 坂本隆

第16回バイオ関連化学シンポジウム  2022.09.10  

生細胞内局所粘度イメージングを目指した３脚型キノンーシアニン近赤外蛍光色素の粘度応答性能の制御

坂本隆, 岩井まり奈

日本ケミカルバイオロジー学会第16回年会  2022.05.31  

３脚型キノン-シアニン色素誘導体の４重鎖および２重鎖DNAに対する蛍光応答

村岡優香, 安原優, 岩井まり奈, 坂本隆

日本ケミカルバイオロジー学会第16回年会  2022.05.31  

蛍光特性の光制御が可能なフォトクロミックDNA蛍光イメージングプローブの開発

三輪好輝, 坂本隆

日本化学会第102春季年会  2022.03.24  

種々のベンゾチアゾリウムカチオン誘導体を含む３脚型キノン-シアニン蛍光色素の核酸に対する蛍光応答

村岡優香, 坂本隆

日本化学会第102春季年会  2022.03.23  

膜透過性官能基を導入した三脚型キノン−シアニン蛍光色素の合成

大谷悠人, 坂本隆

日本化学会第102春季年会  2022.03.23  

核酸構造の色分けイメージングを可能とする蛍光プローブの開発

坂本隆  [Invited]

第17回若手技術者交流会（主催：和歌山県化学技術者協会）  2022.03.03  

A dual fluorescence turn-on probe for simultaneous imaging of double-stranded DNA and G4 DNA

Takashi Sakamoto, Zehui Yu, Yuto Otani

The 48th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2021)  2021.11.12  

A dual-color fluorescence switch-on probe for imaging the dynamics of guanine quadruplexes in cells

Takashi Sakamoto  [Invited]

FIBER Webinar Universe in Nucleic Acids Chemistry 4  2021.11.02  

DNA構造に選択的な２色蛍光スイッチオンプローブを用いた４重鎖構造形成のリアルタイム追跡

坂本隆, 于ゾウ慧, 大谷悠人

第15回バイオ関連化学シンポジウム  2021.09.10  

2重鎖と4重鎖を色分けして検出できる蛍光プローブを用いた細胞内DNAイメージング

坂本隆, 于ゾウ慧, 大谷悠人

第31回バイオ・高分子シンポジウム  2021.06.25  

A Tripodal Quinone-Cyanine Fluorescent Dye for G4 Nucleic Acids Imaging in Cells

Takashi Sakamoto, Zehui Yu, Yuto Otan

日本ケミカルバイオロジー学会第15回年会  2021.06.23  

多点認識によるねじれ型分子内電荷移動制御に基づく糖検出蛍光プローブの開発

佐藤頌, 坂本隆

日本化学会第101春季年会  2021.03.19  

三脚型キノン-シアニン蛍光プローブによる2重鎖及び4重鎖DNAの同時検出

坂本隆, 于ゾウ慧, 大谷悠人

日本化学会第101春季年会  2021.03.19  

ANDゲート型近赤外蛍光分子プローブを用いた細胞核内脱リン酸化酵素活性イメージング

添田嵩章, 坂本隆

日本化学会第101春季年会  2021.03.19  

低分子蛍光プローブを用いたDNA２重鎖形成連鎖反応のラベルフリー検出系の構築

山田陸斗, 森山貴登, 坂本隆

第30回バイオ・高分子シンポジウム  2020.07.31  

核内の脱リン酸化酵素活性に応答する近赤外蛍光分子プローブの開発

添田嵩章, 坂本隆

日本化学会第100春季年会  2020.03.24  

改変型OPA反応と19F NMRを利用したアミノ酸の同時一斉分析

坂本隆, QIU Zhiyong, 稲垣美侑, 藤本健造

日本化学会第100春季年会  2020.03.24  

グルーブバインダーの２重鎖DNA配列選択的な相互作用を利用したハイブリダイゼーション連鎖反応のラベルフリー検出

坂本隆, 山田陸斗

日本化学会第100春季年会  2020.03.22  

Label-free in situ monitoring of the DNA hybridization chain reaction by using sequence-selective minor-groove-binding fluorophores

Takashi Sakamoto, Rikuto Yamada

The 46th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2019)  2019.10.29  

脱リン酸化酵素に応答するANDゲート型DNA検出蛍光プローブの開発

添田嵩章, 坂本隆

第13回バイオ関連化学シンポジウム  2019.09.05  

DNAマイナーグルーブ結合型蛍光色素を用いたハイブリダイゼーション連鎖反応のラベルフリー検出

山田陸斗, 坂本隆

日本化学会第99春季年会  2019.03.18  

ヘキスト系色素の非標準構造DNAに対する光反応の検討

三輪好輝, 瀬戸上慧, 坂本隆

日本化学会第99春季年会  2019.03.17  

19F核磁気共鳴を用いた生体分子の同時一斉計測

坂本隆  [Invited]

2018ハロゲン利用ミニシンポジウム  2018.12.07  

細胞内ホスファターゼ活性イメージングを指向したANDゲート型蛍光プローブの開発

坂本隆

第28回バイオ・高分子シンポジウム  2018.07.26  

Development of fluorescent molecular probe for imaging tyrosine phosphatase activity in cell nuclei

Takashi Sakamoto

日本化学会第98春季年会  2018.03.21  

まとめてイッキに分析！〜生体分子の同時一斉解析技術〜

坂本隆  [Invited]

メディカルジャパン2018大阪 「研究成果企業化促進セミナー」  2018.02.21  

19F NMR を用いたアミノ酸同時一斉解析法の開発

坂本隆, QIU Zhiyong, 藤本健造

第11回バイオ関連化学シンポジウム  2017.09.08  

19F NMR を用いた核酸等生体分子の同時一斉計測技術の開発

坂本隆, 長谷川大策, QIU Zhiyong, 藤本健造

第27回バイオ・高分子シンポジウム（2017.7.27）  2017.07.27  

二本鎖 DNA 中での3ーシアノビニルカルバゾールを用いた光化学的デアミネーションにおけるシトシンの対合塩基の影響

SETHI Siddhant, 大江美成子, 坂本隆, 中村重孝, 藤本健造

日本薬学会第137年会  2017.03.25  

Development of RNA FISH using photoresponsive molecular beacon probe

Chinami Kano, Kei Toyosato, Takashi Sakamoto, Shigetaka Nakamura, Kenzo Fujimoto

日本化学会第97春季年会  2017.03.17  

Development of novel molecular devices capable of photo-cross-linking with DNA having specific structures

Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

日本化学会第97春季年会  2017.03.17  

Biomolecule simultaneous analysis by using 19F NMR

Zhiyong Qiu, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

日本化学会第97春季年会  2017.03.16  

光化学的なRNA架橋反応を用いた新規FISH 法の開発

中村重孝, 豊里慧, 狩野千波, 坂本隆, 藤本健造

第39回日本分子生物学会年会  2016.11.30  

Evaluation of role of hydrogen bonding in deamination of 3-cyanovinylcarbazole mediated photo-cross-linked cytosine in DNA duplex

Siddhant Sethi, Minako Ooe, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

平成28年度北陸地区講演会と研究発表会  2016.11.25  

光架橋反応を用いた新規 RNA FISH 法の開発

狩野千波, 豊里慧, 中村重孝, 坂本隆, 藤本健造

平成28年度北陸地区講演会と研究発表会  2016.11.25  

19F NMRを用いた遊離アミノ酸の同時一斉分析

QIU Zhiyong, 坂本隆, 藤本健造

平成28年度北陸地区講演会と研究発表会  2016.11.25  

Effects of hydrogen bonding on the cytosine deamination in photo-cross-linked DNA duplex

Siddhant Sethi, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2016)  2016.09.27  

RNA FISH using 3-cyanovinylcarbazole-modified ODNs as photo-cross-linking probe

Chinami Kano, Kei Toyosato, Shigetaka Nakamura, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2016)  2016.09.27  

Disassembly-driven signal turn-on probe for multimodal detection of DNAs using 19F NMR and fluorescence

Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto

The 43rd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2016)  2016.09.27  

蛍光・19F NMRデュアルモードDNA検出を可能とするOFF/ON型分子プローブの開発

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

第10 回バイオ関連化学シンポジウム  2016.09.07  

シアノビニルカルバゾールによって光架橋された DNA 上シトシンの脱アミノ化における水素結合の影響

SETHI Siddhant, 坂本隆, 藤本健造

第10 回バイオ関連化学シンポジウム  2016.09.07  

高速光架橋能を有する蛍光プローブを用いたRNA FISH

狩野 千波, 豊里慧, 中村重孝, 坂本隆, 藤本健造

第10 回バイオ関連化学シンポジウム  2016.09.07  

改変型OPA反応を利用した迅速アミノ酸分析法の開発

QIU Zhiyong, 坂本隆, 藤本健造

第10 回バイオ関連化学シンポジウム  2016.09.07  

分子ロボのための核酸光操作ツールの開発

坂本隆  [Invited]

第４回分子ロボ若手会  2016.08.20  

フッ素標識ヘキストプローブを用いた 19F NMR による DNA 検出

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

第26 回バイオ・高分子シンポジウム  2016.07.29  

19F NMRを用いたDNA１塩基多型の同時一斉解析

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

日本化学会第96春季年会  2016.03.27  

Development of molecular probes for 19F NMR/fluorescence bimodal detection of DNAs in living cells

Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto

PACIFICHEM 2015  2015.12.15  

19F NMR-based analysis of the local sequence and structure of DNAs using fluorine-modified bisbenzimide derivative

Daisaku Hasegawa, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

PACIFICHEM 2015  2015.12.15  

Development of a novel fluorescence in situ hybridization method using photoreactive oligonuculeotide as a fluorescent probe

Kei Toyosato, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

PACIFICHEM 2015  2015.12.15  

Photochemical site-directed mutagenesis using 3-cyanovinylcarbazole modified oligodeoxynucleotide

Siddhant Sethi, Minako Ooe, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2015)  2015.09.23  

Fluorine-modified bisbenzimide derivative as a molecular probe for simultaneous detection of DNAs by 19F NMR

Takashi Sakamoto, Daisaku Hasegawa, Kenzo Fujimoto

The 42nd International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2015)  2015.09.23  

異なる核酸の同時検出を可能にする新規核酸検出プローブの開発

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

第9回バイオ関連化学シンポジウム  2015.09.11  

19F核磁気共鳴による核酸検出を可能とする新規分子プローブの開発

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

第 25 回バイオ・高分子シンポジウム  2015.07.24  

蛍光および19F核磁気共鳴によるDNA検出を可能にする新たな分子プローブの開発

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

日本ケミカルバイオロジー学会第10回年会  2015.06.12  

Hoechst 33258骨格を有するDNA検出19F核磁気共鳴プローブの開発

坂本隆, 長谷川大策, 藤本健造

日本化学会第95春季年会  2015.03.26  

Effect of duplex stability on the cytosine deamination using DNA photo-cross-linking reaction

Minako Oe, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2014)  2014.11.05  

To probe human telomere RNA G-quadruplex structure by 19F NMR

Hong-Liang Bao, Takumi Ishizuka, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto, Yan Xu

The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2014)  2014.11.05  

Short oligonucleotide having 5-fluoro and 5-iodouracil acts as an anticancer prodrug

Mirei Furusawa, Yu-ki Takematsu, Atsuo Shigeno, Takashi Sakamoto, Kenzo Fujimoto

The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry (ISNAC2014)  2014.11.05  

核磁気共鳴法に基づく新たな生体分子検出・イメージングプローブの開発

坂本隆  [Invited]

平成26年度 第１回テニュアトラック制度シンポジウム −生命システムに挑む機能分子の化学–  2014.10.17  

高速光架橋性アンチセンス核酸による細胞内遺伝子発現の光制御

坂本隆, 滋野敦夫, 大滝優一, 藤本 健造

第8回バイオ関連化学シンポジウム  2014.09.12  

高速光架橋性アンチセンス核酸による細胞内遺伝子発現制御

坂本隆, 滋野敦夫, 大滝優一, 藤本 健造

アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2014  2014.09.08  

光架橋性オリゴヌクレオチドによる細胞内遺伝子発現制御法の開発

坂本隆, 滋野敦夫, 大滝優一, 藤本健造

第36回日本光医学・光生物学会  2014.07.25  

高速光架橋性オリゴヌクレオチドによる細胞内遺伝子発現制御

坂本隆, 滋野敦夫, 大滝優一, 藤本健造

日本ケミカルバイオロジー学会第9回年会  2014.06.12  

投稿論文の査読

Chemistry and Biodiversity, Wiley-VCH

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Magnetic Resonance in Chemistry, Wiley-VCH

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Advanced Functional Materials, Wiley-VCH

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ACSOmega, American Chemical Society

イノベーションジャパン 2021 ~大学見本市 Online　での講演

科学技術振興機構

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Organic & Biomolecular Chemistry, Royal Society of Chemistry

夢ナビライブでの高校生向けのオンライン講演

株式会社 フロムページ

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Analytica Chimica Acta, Elsevier

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Organic & Biomolecular Chemistry, Royal Society of Chemistry

国立大学56工学系学部おもしろ科学実験室への記事の提供

国立大学56工学系学部長会議

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Biomaterials Science, Royal Society of Chemistry

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ChemBioChem, Wiley-VCH

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Organic & Biomolecular Chemistry, Royal Society of Chemistry

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ChemBioChem, Wiley-VCH

講師

「メディカルジャパン2018大阪」研究成果企業化促進セミナー

研究者交流会（精密物質学科 卒業研究発表会 午前の部終了後）

和歌山大学システム工学部精密物質学科